waarnemingsrecord: ftTrack5_surface_3:MiFish_UE-asv0152

Material Sample van Bacteria opgenomen op 2022-09-29
   API

Dataset

Gegevenspartner Instituut voor Natuur- en Bosonderzoek
Gegevensbron Vertical and horizontal environmental DNA (eDNA) patterns of fish in a shallow and well-mixed North Sea area
Instituutcode (dwc:institutionCode) Opgegeven instelling code "Ilvo"
WaarnemingsID (dwc:occurrenceID) ftTrack5_surface_3:MiFish_UE-asv0152
Record type Material Sample
Verzamelaar Isolde Cornelis  
Geleverd als ""
License CC-BY 4.0 (Int)
Geleverd als CC-BY
Rechtenhouder (dwc:rightsHolder) Ilvo
Instituut ID (dwc:institutionID) https://ror.org/05cjt1n05
Taal (dwc:language) en
Type (dwc:type) Event
Presence/Absence PRESENT
Organisme kwantiteit (dwc:organismQuantity) 69
Materiaal monster ID (dwc:materialSampleID) https://www.ncbi.nlm.nih.gov/biosample/SAMN38358078 | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/biosample/SAMN38358079 | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/biosample/SAMN38358080
Organisme kwantiteit type (dwc:organismQuantityType) DNA sequence reads
Instituutcode eigenaar (dwc:ownerInstitutionCode) Ilvo
Bemonsteringsprotocol (dwc:samplingProtocol) [Niskin Carrousel]
Dataset [https://doi.org/10.15468/3ygzac]
Access rights Ilvo
Identificatie referenties (dwc:identificationReferences) https://github.com/icornelis90/eDNA_metabarcoding_NJ2021/blob/main/Reference%20Databases/12S_references_20230705.fas
Identificatie opmerkingen (dwc:identificationRemarks) rdp annotation confidence: 0.8; blast coverage threshold of 75% and identity threshold of 97% (accession date: 23/03/2023).

Gebeurtenis

Dataset / Survey name Vertical and horizontal environmental DNA (eDNA) patterns of fish in a shallow and well-mixed North Sea area  
Event ID ftTrack5_surface_3
Identificatie opmerkingen (dwc:identificationRemarks) rdp annotation confidence: 0.8; blast coverage threshold of 75% and identity threshold of 97% (accession date: 23/03/2023).
Datum van waarneming 2022-09-29
Bemonsteringsprotocol (dwc:samplingProtocol) Niskin Carrousel  
Einddag van het jaar 272
Precisie datum DAY
Startdag van het jaar (dwc:startDayOfYear) 272

Taxonomie

Scientific name Bacteria
Supplied scientific name "uncultured bacterium"
Identified to rank kingdom
Rijk Bacteria
Stam NA
Class NA
Orde NA
Familie NA
Genus NA
Name match metric higherMatch
Name parse type PLACEHOLDER

Geospatiaal

Land Belgium
Geleverd als "BE"
Latitude 51.55632
Supplied as: "51.55632"
Longitude 2.95767
Supplied as: "2.95767"
Datum EPSG:4326
Supplied datum: "WGS84"
Waterlichaam (dwc:waterBody) North Sea
Coordinate precision Unknown
Terrestrial false
Biome MARINE
Continent Europe
Marine true
Country Code BE

Door gebruiker gemarkeerde problemen 

    Gegevenskwaliteitscontroles

    Testnaam Resultaat
    CONTINENT_COORDINATE_MISMATCH Waarschuwing
    Coordinate uncertainty meters invalid Waarschuwing
    Invalid scientific name Waarschuwing
    Taxon match higher rank Waarschuwing
    Weergeven/Verbergen 85 passed properties
    Weergeven/Verbergen 6 missing properties
    Weergeven/Verbergen 29 tests that have not been run

    Aanvullende informatie over politieke grenzen

    Administratief
    Vlaanderen inclusief de exclusief economische zone Vlaams Gewest

    Milieu-sampling voor deze locatie

    Omgeving
    Digitaal Hoogtemodel Vlaanderen 0.0 m