waarnemingsrecord: MGYA00194368_Bacteria::Proteobacteria:Gammaproteobacteria:Thiotrichales:Piscirickettsiaceae:Thiomicrorhabdus

Material Sample van Thiomicrorhabdus Boden et al., 2017 opgenomen op 2016-03-07

API

Dataset

Gegevensbron	Bacteria exposure experiment North Sea
WaarnemingsID (dwc:occurrenceID)	MGYA00194368_Bacteria::Proteobacteria:Gammaproteobacteria:Thiotrichales:Piscirickettsiaceae:Thiomicrorhabdus
Record type	Material Sample
License	CC-BY 4.0 (Int) Geleverd als CC_BY_4_0
Presence/Absence	PRESENT
Organisme kwantiteit (dwc:organismQuantity)	2
Materiaal monster ID (dwc:materialSampleID)	https://www.ebi.ac.uk/metagenomics/samples/SRS1900460
Organisme kwantiteit type (dwc:organismQuantityType)	DNA sequence reads
Identificatie referenties (dwc:identificationReferences)	https://www.ebi.ac.uk/metagenomics/pipelines/4.1
Identificatie opmerkingen (dwc:identificationRemarks)	SSU rRNA annotated using the taxonomic reference database described here: https://www.ebi.ac.uk/metagenomics/pipelines/4.1. This occurrence appeared in following analyses: SSU taxonomy from analyses https://www.ebi.ac.uk/metagenomics/analyses/MGYA00194368#taxonomic.

Gebeurtenis

Event ID	MGYA00194368
Identificatie opmerkingen (dwc:identificationRemarks)	SSU rRNA annotated using the taxonomic reference database described here: https://www.ebi.ac.uk/metagenomics/pipelines/4.1. This occurrence appeared in following analyses: SSU taxonomy from analyses https://www.ebi.ac.uk/metagenomics/analyses/MGYA00194368#taxonomic.
Datum van waarneming	2016-03-07 Geleverd als jaar:2016 maand:3 dag:7
Einddag van het jaar	67
Opmerkingen bij het event	Ponton_t27_touw1
Precisie datum	DAY
Startdag van het jaar (dwc:startDayOfYear)	67

Taxonomie

Scientific name	Thiomicrorhabdus
Identified to rank	genus
Rijk	Bacteria
Stam	Proteobacteria
Class	Gammaproteobacteria
Orde	Thiomicrospirales Geleverd als "Thiotrichales"
Familie	Thiomicrospiraceae Geleverd als "Piscirickettsiaceae"
Genus	Thiomicrorhabdus
Name match metric	exactMatch
Accepted name	9239632
Auteursnaam (dwc:scientificNameAuthorship)	Boden et al., 2017
Name parse type	SCIENTIFIC
Taxonomische status (dwc:taxonomicStatus)	ACCEPTED

Geospatiaal

Land	Belgium
Latitude	51.23 Supplied as: "51.23"
Longitude	2.93 Supplied as: "2.93"
Datum	EPSG:4326 Supplied datum: "WGS84"
Waterlichaam (dwc:waterBody)	North Sea
Minimum depth in metres	6.0
Maximum depth in metres	6.0
Coordinate precision	Unknown
Terrestrial	true
Biome	TERRESTRIAL
Continent	EUROPE
Marine	false
Country Code	BE

Aanvullende eigenschappen

accepted scientific name	Thiomicrorhabdus Boden et al., 2017
accepted taxon key	9239632
collection date	2016-03-07
collection date	2016-03-07
core id	2025142892
dataset key	d5ffc321-09f2-48f0-95a8-9aeefc2145d2
environment (biome)	marine biome
environment (feature)	sea water
environment (material)	water
environment biome	marine biome
environment feature	sea water
environment material	water
family key	10701530
gbif id	2025142892
genus key	9239632
geographic location (country and/or sea,region)	North Sea
geographic location (latitude)	51.23
geographic location (longitude)	2.93
geographic location country and or sea region	North Sea
geographic location latitude	51.23
geographic location longitude	2.93
has geospatial issues	false
instrument model	Illumina MiSeq
instrument model	Illumina MiSeq
kingdom key	3
last crawled	2025-09-06T14:14:29.351Z
last interpreted	2025-09-06T14:15:21.376Z
last parsed	2025-09-06T14:15:21.376Z
level0gid	BEL
level0name	Belgium
level1gid	BEL.2_1
level1name	Vlaanderen
level2gid	BEL.2.5_1
level2name	West-Vlaanderen
level3gid	BEL.2.5.5_1
level3name	Oostende
order key	10877030
phylum key	111
protocol	DWC_ARCHIVE
publisher	MGnify
taxon key	9239632
verbatim scientific name	Thiomicrorhabdus

Door gebruiker gemarkeerde problemen

Gegevenskwaliteitscontroles

Testnaam	Resultaat
CONTINENT_COORDINATE_MISMATCH	Waarschuwing
Coordinate uncertainty meters invalid	Waarschuwing
Weergeven/Verbergen 85 passed properties
Basis of record badly formed	Geslaagd
Continent country mismatch	Geslaagd
Continent derived from coordinates	Geslaagd
CONTINENT_DERIVED_FROM_COUNTRY	Geslaagd
Continent invalid	Geslaagd
Coordinates centre of country	Geslaagd
Supplied coordinates centre of state	Geslaagd
Coordinate invalid	Geslaagd
Coordinates are out of range for species	Geslaagd
Coordinates converted to WGS84	Geslaagd
Decimal latitude/longitude conversion failed	Geslaagd
Coordinate reprojection suspicious	Geslaagd
Coordinate rounded	Geslaagd
Coordinates dont match supplied country	Geslaagd
Country inferred from coordinates	Geslaagd
Country invalid	Geslaagd
Country mismatch	Geslaagd
Min and max depth reversed	Geslaagd
Depth value non-numeric	Geslaagd
Depth value supplied in feet	Geslaagd
Depth unlikely	Geslaagd
First of the century	Geslaagd
First of the month	Geslaagd
First of the year	Geslaagd
Geodetic datum assumed WGS84	Geslaagd
Unrecognized geodetic datum	Geslaagd
Georeferenced after occurrence date	Geslaagd
Identification date before occurrence date	Geslaagd
Interpretation error	Geslaagd
Invalid scientific name	Geslaagd
Location not supplied	Geslaagd
Missing collection date	Geslaagd
Missing geodetic datum	Geslaagd
Missing taxon rank	Geslaagd
Multimedia date invalid	Geslaagd
Multimedia uri invalid	Geslaagd
Name not supplied	Geslaagd
Occurrence status inferred from basis of record	Geslaagd
Occurrence status inferred from individual count	Geslaagd
Occurrence status unparsable	Geslaagd
Latitude is negated	Geslaagd
Longitude is negated	Geslaagd
Presumed swapped coordinate	Geslaagd
Recorded date invalid	Geslaagd
Recorded date mismatch	Geslaagd
Recorded date unlikely	Geslaagd
SCIENTIFIC_NAME_AND_ID_INCONSISTENT	Geslaagd
Sensitivity report invalid	Geslaagd
Sensitivity report not loadable	Geslaagd
Coordinates dont match supplied state	Geslaagd
Taxon affinity species	Geslaagd
TAXON_CONCEPT_ID_NOT_FOUND	Geslaagd
Taxon confer species	Geslaagd
Taxon default match	Geslaagd
Taxon error	Geslaagd
Taxon excluded	Geslaagd
Taxon excluded associated	Geslaagd
Taxon homonym	Geslaagd
Taxon indeterminate species	Geslaagd
Taxon match aggregate	Geslaagd
Taxon match fuzzy	Geslaagd
Taxon match higher rank	Geslaagd
TAXON_MATCH_NAME_AND_ID_AMBIGUOUS	Geslaagd
Taxon match none	Geslaagd
TAXON_MATCH_TAXON_CONCEPT_ID_IGNORED	Geslaagd
Taxon misapplied	Geslaagd
Taxon misapplied matched	Geslaagd
Taxon parent child synonym	Geslaagd
Taxon question species	Geslaagd
Resource taxonomic scope mismatch	Geslaagd
Taxon species plural	Geslaagd
Coordinate precision and uncertainty transposed	Geslaagd
Uncertainty not specified	Geslaagd
Supplied country not recognised	Geslaagd
Kingdom not recognised	Geslaagd
Supplied coordinates are zero	Geslaagd
Biosecurity probleem	Geslaagd
Vermoedelijke uitschieter	Geslaagd
Geospatiaal probleem	Geslaagd
Habitat onjuist voor soort	Geslaagd
Taxon verkeerd geïdentificeerd	Geslaagd
Taxonomisch probleem	Geslaagd
Tijdelijk probleem	Geslaagd
Ander probleem	Geslaagd
Duplicaat record	Geslaagd
Weergeven/Verbergen 5 missing properties
Missing georeferenced by	Ontbrekend
Missing georeference protocol	Ontbrekend
Missing georeference sources	Ontbrekend
Missing georeference verification status	Ontbrekend
Missing georeference date	Ontbrekend
Weergeven/Verbergen 32 tests that have not been run
Unrecognized collection code	Niet gecontroleerd (gebrek aan gegevens)
Unrecognized institution code	Niet gecontroleerd (gebrek aan gegevens)
Coordinate precision invalid	Niet gecontroleerd (gebrek aan gegevens)
Footprint SRS invalid	Niet gecontroleerd (gebrek aan gegevens)
Footprint WKT mismatch	Niet gecontroleerd (gebrek aan gegevens)
Footprint WKT invalid	Niet gecontroleerd (gebrek aan gegevens)
TAXON_MATCH_SCIENTIFIC_NAME_ID_IGNORED	Niet gecontroleerd (gebrek aan gegevens)
TAXON_MATCH_TAXON_ID_IGNORED	Niet gecontroleerd (gebrek aan gegevens)
SCIENTIFIC_NAME_ID_NOT_FOUND	Niet gecontroleerd (gebrek aan gegevens)
TAXON_ID_NOT_FOUND	Niet gecontroleerd (gebrek aan gegevens)
Elevation unlikely	Niet gecontroleerd (gebrek aan gegevens)
Min and max altitude reversed	Niet gecontroleerd (gebrek aan gegevens)
Altitude value supplied in feet	Niet gecontroleerd (gebrek aan gegevens)
Altitude value non-numeric	Niet gecontroleerd (gebrek aan gegevens)
Modified date invalid	Niet gecontroleerd (gebrek aan gegevens)
Modified date unlikely	Niet gecontroleerd (gebrek aan gegevens)
Identified date unlikely	Niet gecontroleerd (gebrek aan gegevens)
Identified date invalid	Niet gecontroleerd (gebrek aan gegevens)
Type status invalid	Niet gecontroleerd (gebrek aan gegevens)
References uri invalid	Niet gecontroleerd (gebrek aan gegevens)
Individual count invalid	Niet gecontroleerd (gebrek aan gegevens)
Individual count conflicts with occurrence status	Niet gecontroleerd (gebrek aan gegevens)
Georeferenced date unlikely	Niet gecontroleerd (gebrek aan gegevens)
Georeferenced date invalid	Niet gecontroleerd (gebrek aan gegevens)
Ambiguous institution	Niet gecontroleerd (gebrek aan gegevens)
Ambiguous collection	Niet gecontroleerd (gebrek aan gegevens)
Institution not matched	Niet gecontroleerd (gebrek aan gegevens)
Collection not matched	Niet gecontroleerd (gebrek aan gegevens)
Institution match fuzzy	Niet gecontroleerd (gebrek aan gegevens)
Collection match fuzzy	Niet gecontroleerd (gebrek aan gegevens)
Institution and Collection mismatch	Niet gecontroleerd (gebrek aan gegevens)
Different owner institution	Niet gecontroleerd (gebrek aan gegevens)

Aanvullende informatie over politieke grenzen

Administratief
Gemeenten Vlaanderen	Oostende
Gewest Vlaanderen	Vlaams Gewest
Provincies	West-Vlaanderen
Vlaanderen	Vlaams Gewest
Vlaanderen inclusief de exclusief economische zone	Vlaams Gewest
Area
Biologische waarderingskart HabitatType	ui
Hydrografie
Vlaamse Hydrografische Atlas: Deelbekken	Bekken Brugse polders
Locatie
IFBL	c1-14
UTM 5	DS97B

Milieu-sampling voor deze locatie

Klimaat
Isothermie	31.862745
Jaarlijkse neerslag	724.0 mm
Max temperatuur van de warmste maand	21.5 °C
Mediaan jaarlijkse temperatuur	10.225 °C
Mediaan maandelijks temperatuurbereik	6.5 °C
Mediaan temperatuur van het droogste kwartaal	6.1666665 °C
Mediaan temperatuur van het koudste kwartaal	4.2833333 °C
Mediaan temperatuur van het natste kwartaal	7.9 °C
Mediaan temperatuur van het warmste kwartaal	16.55 °C
Min temperatuur van de koudste maand	1.1 °C
Neerslag seizoensgebondenheid	19.948486
Neerslag tijden het warmste kwartaal	191.0 mm
Neerslag tijdens de droogste maand	43.0 mm
Neerslag tijdens de natste maand	81.0 mm
Neerslag tijdens het droogste kwartaal	137.0 mm
Neerslag tijdens het koudste kwartaal	172.0 mm
Neerslag tijdens het natste kwartaal	228.0 mm
Temperatuur jaarlijks bereik	20.4 °C
Temperatuur seizoensgebondenheid	487.9617
Omgeving
Veenwaarschijnlijkheid 1,5-50m	2.0
Veenwaarschijnlijkheid bodemprofiel	0.0
Veenwaarschijnlijkheid oppervlakteveen	0.0

Groep	Veldnaam	Oorspronkelijke waarde	Verwerkte waarde


Classification	Wetenschappelijke naam (dwc:scientificName)	Thiomicrorhabdus	Thiomicrorhabdus
	Match type		exactMatch
	Phylum id		111
	Family id		10701530
	Taxon concept ID (dwc:taxonConceptID)		9239632
	Orde (dwc:order)	Thiotrichales	Thiomicrospirales
	Taxon rank id		6000
	Genus	Thiomicrorhabdus	Thiomicrorhabdus
	Left		6063169
	Geaccepteerd naamgebruik ID (dwc:acceptedNameUsageID)	9239632
	Auteursnaam (dwc:scientificNameAuthorship)		Boden et al., 2017
	Taxonomische rang (dwc:taxonRank)	genus	genus
	Genus id		9239632
	Name type		SCIENTIFIC
	Order id		10877030
	Taxonomische status (dwc:taxonomicStatus)	ACCEPTED
	Right		6063187
	Rijk (dwc:kingdom)	Bacteria	Bacteria
	Class id		362
	Stam (dwc:phylum)	Proteobacteria	Proteobacteria
	Class	Gammaproteobacteria	Gammaproteobacteria
	Familie	Piscirickettsiaceae	Thiomicrospiraceae
	Kingdom id		3
Event	ID van het event	MGYA00194368
	Jaar (dwc:year)	2016	2016
	Einddag van het jaar	67	67
	Opmerkingen bij het event	Ponton_t27_touw1
	Maand (dwc:month)	3	3
	Date precision		DAY
	Startdag van het jaar (dwc:startDayOfYear)	67	67
	Dag	7	7
	Datum van het event	2016-03-07	2016-03-07
Identificatie	Identificatie referenties (dwc:identificationReferences)	https://www.ebi.ac.uk/metagenomics/pipelines/4.1
Identificatie	Identificatie opmerkingen (dwc:identificationRemarks)	SSU rRNA annotated using the taxonomic reference database described here: https://www.ebi.ac.uk/metagenomics/pipelines/4.1. This occurrence appeared in following analyses: SSU taxonomy from analyses https://www.ebi.ac.uk/metagenomics/analyses/MGYA00194368#taxonomic.
Waarnemingen	Status van voorkomen (dwc:occurrenceStatus)	PRESENT	PRESENT
	Basis van record (dwc: basisOfRecord)	MATERIAL_SAMPLE	MATERIAL_SAMPLE
	Organisme kwantiteit (dwc:organismQuantity)		2
	Materiaal monster ID (dwc:materialSampleID)	https://www.ebi.ac.uk/metagenomics/samples/SRS1900460
	WaarnemingsID (dwc:occurrenceID)	MGYA00194368_Bacteria::Proteobacteria:Gammaproteobacteria:Thiotrichales:Piscirickettsiaceae:Thiomicrorhabdus
	Organisme kwantiteit type (dwc:organismQuantityType)	DNA sequence reads	DNA sequence reads
Toeschrijving	Gegevensbron		Bacteria exposure experiment North Sea
	Licentie (dwc:license)	CC_BY_4_0	CC-BY 4.0 (Int)
	Data Resource ID	dr0	dr0
Locatie	Land		Belgium
	Decimale breedtegraad (dwc:decimalLatitude)	51.23	51.23
	Terrestrial	true	true
	Maximale diepte in meters (dwc:maximumDepthInMeters)	6.0	6.0
	Decimale lengtegraad (dwc:decimalLatitude)	2.93	2.93
	Biome		TERRESTRIAL
	Continent	EUROPE
	Marine	false	false
	Minimale diepte in meters (dwc:minimumDepthInMeters)	6.0	6.0
	Landcode	BE	BE
	Geodetische datum	WGS84	EPSG:4326
	Waterlichaam (dwc:waterBody)	North Sea	North Sea

waarnemingsrecord: MGYA00194368_Bacteria::Proteobacteria:Gammaproteobacteria:Thiotrichales:Piscirickettsiaceae:Thiomicrorhabdus

Dataset

Gebeurtenis

Taxonomie

Geospatiaal

Aanvullende eigenschappen

Door gebruiker gemarkeerde problemen

Gegevenskwaliteitscontroles

Aanvullende informatie over politieke grenzen

Milieu-sampling voor deze locatie

- gemarkeerd door